سازمان نظام پزشکی کشور همچون سایر سازمانهای صنفی، دارای آیین نامه انتظامی می باشد که رسیدگی به تخلفات اعضای خود را بر اساس این آیین نامه انتظامی انجام می دهد. در این آیین نامه به انواع مجازاتهای انتظامی اشاره شده است این موارد بر اساس افزایش شدت تنبیهات در نظر گرفته شده در زیر آورده شده اند ماده30- مجازات هاي انتظامي به شرح زير تعيين مي شود : الف:تذکر يا توبيخ شفاهي در حضور هيأت مديره نظام پزشکي محل. ب:اخطار و توبيخ کتبي با درج در پرونده نظام پزشکي محل. ج:توبيخ کتبي با درج در پرونده نظام پزشکي و نشريه نظام پزشکي محل يا الصاق راي در تابلو اعلانات نظام پزشکي محل. د:محروميت از اشتغال به حرفه هاي پزشکي و وابسته از سه ماه تا يکسال در محل ارتکاب تخلف. ه:محروميت از اشتغال به حرفه هاي پزشکي و وابسته از سه ماه تا يکسال در تمام کشور. و:محروميت از اشتغال به حرفه هاي پزشکي و وابسته از بيش از يکسال تا پنچ سال در تمام کشور. ز:محروميت دائم از اشتغال به حرفه هاي پزشکي و وابسته در تمام کشور. لازم به ذکر است که هر چه خطای انتظامی فردی از اعضای سازمان نظام پزشکی شدیدتر و بزرگتر باشد شدت مجازات در نظر گرفته شده نیز بیشتر خواهد شد البته باید به این نکته نیز اشاره نمود که اغلب مجازاتهای انتظامی در نظر گرفته شده برای متخلفین جامعه پزشکی در سالهای اخیر مربوط به موارد الف ، ب وج بوده است و هر چه شدت مجازات افزایش یابد از فراوانی آراء صادر شده به وضوح کاسته می شود به گونه ای که "محکومیت دائم از اشتغال به حرفه ها پزشکی و وابسته در تمام کشور" مجازاتی است که در موارد بسیار نادر رخ داده است باید توجه داشت که صدور چنین احکامی از طرف سازمان نظام پزشکی به عنوان مرجع صنفی رسیدگی کننده به شکایات پزشکی ، جدا از احکامی است که از طرف مرجع قضایی (دادگاه دادگستری ) صادر می گردد و بسیار پیش آمده است که پزشک محکوم شده در سازمان نظام پزشکی ، در مراجع قضایی نیز محکوم شده و مجبور به تحمل دو مجازات از دو جنس مختلف شده است یکی انتظامی و دیگری قضایی . برای مثال" اخطار و توبيخ کتبي با درج در پرونده نظام پزشکي محل" به عنوان مجازات انتظامی و محکومیت به پرداخت دیه به عنوان محکومیت قضایی.